Команда ученых НИИ им. Луненфельда-Таненбаума и Университета Торонто разработала новую технологию соединения штрих-кодов ДНК внутри клетки для мгновенного поиска протеиновых взаимодействий по миллионам белковых пар. Статья опубликована в журнале Molecular Systems Biology.
За последние годы штрихкодирование ДНК позволило ученым проводить одновременные эксперименты по использованию различных типов клеток в той же самой пробирке. Однако, число тестов, которые можно проводить одновременно, ограничено числом типов клеточных штрих-кодов. Если объединить внутри клетки несколько штрих-кодов, ученые смогут преодолеть этот барьер. Новая технология в 10 раз повышает скорость исследований, пишет EurekAlert.
Ученые открыли технологию CRISPR-радуги
Идеи
В широко распространенной технологии двугибридного анализа дрожжей (Y2H) клетки дрожжей, которые содержат «приманку» в виде белка, соединяются с клетками дрожжей с «хищным» протеином. Система Y2H устроена так, что выжить могут только те клетки, в которых «приманка» и «хищник» находятся вместе. Это позволяет ученым видеть, какие белки связаны друг с другом. Метод получил название генетики сплава штрих-кодов (BFG-H2H).
По словам Эвангелии Петсалаки, одного из соавторов статьи, «конечная цель — создать скорее „трехмерное видео“ карты взаимодействий белка, а не статичное изображение. Наш метод BFG-H2H улучшит понимание функций генов и человеческих заболеваний, поскольку мы создаем информационно насыщенную карту белковых взаимовлияний».
