CRISPR-Cas9 — революционная технология редактирования генома, и до сих пор большинство исследований было направлено на сайленсинг (подавление экспрессии) генов, кодирующих белок, наиболее изученной области. Однако наш геном на 99% состоит из ДНК, которая не кодирует белок, но крайне важна для понимания человеческой биологии.
В Лаборатории Джонсона недавно создали инструмент DECKO, основанный на CRISPR-Cas9, которым можно удалять любые части некодирующей ДНК. Он использует два уникальных sgRNA в качестве молекулярных ножниц, которые отрезают части ДНК. Этот подход получил широкое распространение, но для создания пар sgRNA не было программы, и поэтому проведение эксперимента всегда отнимало много времени.
Иркутский стартап за сутки напечатал дом, потратив 600 тысяч рублей
Кейсы
Ученые под руководством Карлоса Пулидо разработали ПО CRISPETa, гибкое решение для проведения экспериментов по удалению ДНК. Пользователь сообщает, какую часть он хочет удалить, и программа выдает ему пару оптимизированных молекул sgRNA, готовых к использованию, пишет Phys.org.
Большим плюсом ПО CRISPETa является и то, что оно предназначено для применения в самых скромных лабораторных условиях. «Мы надеемся, что новая программа позволит максимальному числу исследователей овладеть силой CRISPR», — говорит Пулидо, написавший программу CRISPETa.
Создатель Linux: «Разговоры об инновациях — полная чушь»
Мнения
Стартап Exonics планирует применять технологию CRISPR для лечения миодистрифии Дюшенна, вызванной мутацией гена дистрофина. Эта болезнь считается неизлечимой. Подобную операцию уже проводили на мышах, но еще ни разу — на живом человеке.