Программу CancerLocator разработали ученые Калифорнийского университета в Лос-Анджелесе и Университета Южной Калифорнии. Методика диагностирует рак по измерению опухолевой ДНК в крови, а дополнительный анализ позволяет определить источник новообразования.
Методика жидкой биопсии позволяет диагностировать рак по биомаркерам в крови. Роль биомаркеров выполняет циркулирующая опухолевая ДНК — частички ДНК, которые попадают в кровь от отмирающих клеток опухоли. Опухолевые клетки часто характеризуются отклонениями в метильных паттернах ДНК, в том числе в повышенном уровне метилирования. Именно эти данные позволяют диагностировать болезнь по анализу крови и определить с помощью систем статистического обучения, для какого органа или ткани характерны такие метильные паттерны.
Открыт механизм запуска саморазрушения раковых клеток
Идеи
В ходе исследования американские ученые изучили циркулирующую опухолевую ДНК у пациентов с раком печени, легких и груди. Для этого они использовали две системы на основе машинного обучения Support Vector Machine и Random Forest, а также собственную программу CancerLocator. Каждый из образцов крови проверяли по 10 раз. Частота ошибок при использовании CancerLocator оказалась минимальной — 0,265, тогда как у Support Vector Machine и Random Forest этот показатель составил 0,646 и 0,604. Новая программа достигла 80% точности при диагностике рака легких и печени на ранней стадии, сообщает Digital Trends.
Результаты исследования были опубликованы в журнале Genome Biology. Ученые продолжат дорабатывать методику, так как пока ее эффективность официально не подтверждена. Если результаты подтвердятся, то новый вид диагностики поможет диагностировать рак еще до того, как появятся выраженные симптомы. Как отмечают ученые, в США от рака легких умирает больше всего онкобольных, так как его сложнее всего распознать на раннем этапе.
Создано лекарство от старости и для полетов на Марс
Идеи
В ближайшие годы сразу несколько компаний представит на рынке свои методики жидкой биопсии. Стартап Grail, разрабатывающий диагностику рака на ранних стадиях по анализу крови, получил $900 млн инвестиций. Это самый крупный объем финансирования в области медицинской диагностики за всю историю. Универсальный тест на все виды рака Grail представит уже в 2019 году. Другой американский стартап Freenome привлек $65 млн на разработку жидкой биопсии. Компания уже приступила к клиническим испытаниям.