Разработан алгоритм создания новых антибиотиков против супербактерий

Алгоритм VarQuest серьезно ускоряет поиск новых вариаций известных антибиотиков - эта методика призвана бороться с супербактериями, которые вырабатывают иммунитет к существующим лекарствам. Большой вклад в создание алгоритма внесли российские биологи из Центра алгоритмической биотехнологии при СПбГУ.

Устойчивые к известным антибиотикам микроорганизмы называют супербактериями, и их распространение — одна из самых серьезных проблем современной медицины. Такие бактерии вырабатывают механизмы сопротивления известным лекарствам (антибиотикорезистивность). Против них помогли бы новые виды антбиотиков. Однако поиск новых вариаций — очень трудоемкая задача без гарантированного результата, отмечает Futurism. Вернее — была таковой до настоящего времени, утверждают российские ученые.

Водородные велосипеды попадут на массовый рынок через год-два

Статья о новом алгоритме поиска вариаций известных антибактериальных препаратов опубликована в журнала Nature Microbiology. В работе принимали участие пятеро ученых из России: Алексей Гуревич, Алла Михеенко, Александр Шлемов, Антон Коробейников и Павел Певзнер. Все они работают в Центре алгоритмической биотехнологии при СПбГУ. В этом исследовании россияне сотрудничали с Хосейном Мохимани из американского Университета Карнеги-Меллона.

Ученые нацелились на поиск новых вариантов известных пептидных антибиотиков. В пресс-релизе Мохимани утверждает. что разработанный учеными алгоритм VarQuest за несколько часов работы выявил в десять раз больше вариаций антибиотиков, известных как PNP (peptidic natural products), чем все исследования в этой области до настоящего момента. Традиционными методами такой объем исследований нарабатывался бы столетиями, подчеркивает он.

Придуманную россиянами криптовалюту раздают по монете за 1000 шагов

Всего ученые нашли более тысячи вариантов препаратов. Ранее появление даже одного варианта медицинское сообщество встречало как новую надежду в битве с супербактериями. «Наши результаты показали, что антибиотики, которые вырабатывают бактерии, намного более разнообразны, чем предполагалось ранее», — указывает Мохимани. По его оценке, одно из важнейших свойств VarQuest — способность указать исследователям на паттерны, которые в противном случае остались бы незамеченными.

VarQuest работает на основе базы данных Global Natural Products Social (GNPS), запущенной в 2016 году. Исследователи со всего мира вносят туда данные масс-спектрометрии полученных органических веществ. «Теперь исследования органики — территория Big Data, и область знаний надо подготовить к этой трансформации в плане сбора (образцов), их хранения и осмысления с учетом Big Data», — говорит Мохимани.

В мозге обнаружен механизм, отвечающий за творческое мышление

О том, что бактерии учатся противостоять антибиотикам, было известно давно, но у медиков всегда был экстренный вариант — карбапенемы, антибиотики с широким спектром действия. Однако по итогам 2016 года в США были зафиксированы сотни смертей от новой энтеробактерии, которая никак не реагировала на все существующие антибиотики.

Подписывайтесь
на наши каналы в Telegram

«Хайтек»новостионлайн

«Хайтек»Dailyновости 3 раза в день

Первая полоса
Найдена странная клеточная сущность на грани жизни
Наука
Ученые раскрыли тайну странного поведения у акул
Наука
Госдума утвердила закон о едином магазине приложений: RuStore становится обязательным
Новости
Путин утвердил запуск цифрового сервиса: мессенджер, «Госуслуги» и ID в одном приложении
Новости
Астрономы раскрыли тайну рождения редких двойных горячих юпитеров
Космос
В янтаре нашли следы грибков-зомби, которым 99 000 000 лет
Наука
Google выпустила автономный «мозг» для роботов: новая модель работает без сети
Новости
В Сингапуре открыли способ омолодить сердце, не меняя клетки
Наука
Возраст стоянки древних людей в Красноярске увеличили на 10 000 лет
Наука
Стартап представил технологию, делающую кровь «прозрачной» во время операций
Наука
Посмотрите, как притягиваются одноименно заряженные частицы
Наука
Наша Вселенная прибыла из другого мира: теория мироздания оказалась неверна
Космос
Появилась безопасная альтернатива препаратам от диабета и ожирения
Наука
Посмотрите на миллионы звезд и 2000 астероидов в беспрецедентном качестве
Космос
Облик древнего существа впервые восстановили в лаборатории: ему 580 млн лет
Наука
Спрос на специалистов по безопасности ИИ в России вырос в четыре раза
Новости
Опасный астероид может столкнуться с Луной вместо Земли: это угрожает спутникам
Космос
Строение перьев совы скопировали для разработки универсальной шумоизоляции
Наука
Популярный антидепрессант нарушил созревание половых клеток у мышей
Наука
На орбиту впервые отправили квантовый компьютер
Космос