Разработан алгоритм создания новых антибиотиков против супербактерий

Алгоритм VarQuest серьезно ускоряет поиск новых вариаций известных антибиотиков - эта методика призвана бороться с супербактериями, которые вырабатывают иммунитет к существующим лекарствам. Большой вклад в создание алгоритма внесли российские биологи из Центра алгоритмической биотехнологии при СПбГУ.

Устойчивые к известным антибиотикам микроорганизмы называют супербактериями, и их распространение — одна из самых серьезных проблем современной медицины. Такие бактерии вырабатывают механизмы сопротивления известным лекарствам (антибиотикорезистивность). Против них помогли бы новые виды антбиотиков. Однако поиск новых вариаций — очень трудоемкая задача без гарантированного результата, отмечает Futurism. Вернее — была таковой до настоящего времени, утверждают российские ученые.

Водородные велосипеды попадут на массовый рынок через год-два

Статья о новом алгоритме поиска вариаций известных антибактериальных препаратов опубликована в журнала Nature Microbiology. В работе принимали участие пятеро ученых из России: Алексей Гуревич, Алла Михеенко, Александр Шлемов, Антон Коробейников и Павел Певзнер. Все они работают в Центре алгоритмической биотехнологии при СПбГУ. В этом исследовании россияне сотрудничали с Хосейном Мохимани из американского Университета Карнеги-Меллона.

Ученые нацелились на поиск новых вариантов известных пептидных антибиотиков. В пресс-релизе Мохимани утверждает. что разработанный учеными алгоритм VarQuest за несколько часов работы выявил в десять раз больше вариаций антибиотиков, известных как PNP (peptidic natural products), чем все исследования в этой области до настоящего момента. Традиционными методами такой объем исследований нарабатывался бы столетиями, подчеркивает он.

Придуманную россиянами криптовалюту раздают по монете за 1000 шагов

Всего ученые нашли более тысячи вариантов препаратов. Ранее появление даже одного варианта медицинское сообщество встречало как новую надежду в битве с супербактериями. «Наши результаты показали, что антибиотики, которые вырабатывают бактерии, намного более разнообразны, чем предполагалось ранее», — указывает Мохимани. По его оценке, одно из важнейших свойств VarQuest — способность указать исследователям на паттерны, которые в противном случае остались бы незамеченными.

VarQuest работает на основе базы данных Global Natural Products Social (GNPS), запущенной в 2016 году. Исследователи со всего мира вносят туда данные масс-спектрометрии полученных органических веществ. «Теперь исследования органики — территория Big Data, и область знаний надо подготовить к этой трансформации в плане сбора (образцов), их хранения и осмысления с учетом Big Data», — говорит Мохимани.

В мозге обнаружен механизм, отвечающий за творческое мышление

О том, что бактерии учатся противостоять антибиотикам, было известно давно, но у медиков всегда был экстренный вариант — карбапенемы, антибиотики с широким спектром действия. Однако по итогам 2016 года в США были зафиксированы сотни смертей от новой энтеробактерии, которая никак не реагировала на все существующие антибиотики.

Подписывайтесь
на наши каналы в Telegram

«Хайтек»новостионлайн

«Хайтек»Dailyновости 3 раза в день

Первая полоса
Процессорный модуль «Фишт» запустили в производство: заменит зарубежные аналоги  
Новости
НАСА сообщило о возможных следах древней жизни на Марсе  
Космос
Робот TRON 1 научился прыгать через барьеры и взбираться по лестницам  
Новости
Проект мощнейших в мире приливных турбин запустили во Франции
Новости
Суперкомпьютер раскрыл тайны «молекулярного ремонта» ДНК
Наука
В Китае разработали батарейку с радиоактивным углеродом, которая проработает до 100 лет
Наука
Ученые MIT разработали «простой способ» превратить клетки кожи в нейроны
Наука
Microsoft запускает ИИ Copilot для геймеров: он будет работать, как тренер
Новости
Частный лунный модуль сфотографировал солнечное затмение с Луны
Космос
Почему Вселенная несимметрична: физики приблизились к разгадке тайны
Новости
Посмотрите на обратную сторону спутника Марса: это второе фото в истории
Новости
Это приложение буквально заставляет трогать траву и блокирует соцсети
Новости
Посмотрите на место гибели лунного аппарата «Афина»
Новости
Apple призвала срочно обновить iPhone из-за критической уязвимости  
Новости
В РосНИИРОС опровергли планы ICANN закрыть домен .su  
Новости
Европейские охотники каменного века «путешествовали» по морю в Африку
Наука
Зонд «Гера» сделал снимки спутника Марса на пути к «пострадавшему в ДТП» астероиду
Космос
В испанской пещере нашли «фрагменты лица» древнейшего жителя Западной Европы
Наука
Стартап представил робота, который готовит как шеф-повар лучших ресторанов
Новости
В паровом реакторе впервые зажгли термоядерную плазму
Новости