20 ноября 2018

В американском лесу нашли 16 новых гигантских вирусов, живущих в грязи

В американском штате Массачусетс биологи более 30 лет проводят самый длинный эксперимент в истории человечества по потоплению почвы. В рамках исследования ученые анализируют, как повышение температуры почвы и увеличение влажности влияют на бактерии, живущие в грязи.

Целью эксперимента была изоляция бактерий непосредственно от окружающей среды для анализа их реакции на потепление температуры почвы. В итоге биологи случайно обнаружили 16 новых супервирусов. Некоторые из них обычно живут только в водной среде, других ученые раньше вообще никогда не встречали, пишет Nature со ссылкой на биолога Джеффа Бланшара из Университета Массачусетса.

Новые вирусы, в отличие от обычных, обладают гораздо большим размером и сложными геномами.

Метагеномные данные, полученные здесь с одной выборки, содержат гораздо больше новых гигантских геномов вирусов, чем в любом другом месте на земле.

Биоинформатик Фредерик Шульц

При этом ученые только начали анализировать результаты эксперимента, поэтому в дальнейшем количество найденых вирусов может увеличиться в несколько раз.

Для идентификации вирусов исследователи суспендировали их в растворе, содержащем нетоксичный краситель, который связывается с ДНК. После этого они использовали метод, называемый флуоресцентно-активированной сортировкой клеток (FACS). С его помощью можно выделить отдельные клетки. Дополнительный метод, известный как мини-метагеномика, помог команде упорядочить ДНК 2 тыс. отдельных клеток, что в конечном итоге привело к открытию 16 гигантских сухопутных вирусов, неизвестных науке до сих пор.