Исследователи из Университета Висконсин-Мэдисон и сотрудники Калифорнийского университета в Сан-Франциско использовали инструмент редактирования генов CRISPR для изучения того, какие гены являются мишенями для конкретных антибиотиков. Таким образом они планируют улучшить существующие антибиотики или разработать новые препараты.
Устойчивость болезнетворных патогенов к действующим антибиотикам является растущей проблемой, которая может поставить под угрозу миллионы жизней и стоить более $2 млрд в год только в США.
Техника, известная как Mobile-CRISPRi, позволяет ученым проводить скрининг на функцию антибиотиков в широком спектре патогенных бактерий. Система снижает выработку белка из целевых генов, что позволяет исследователям определить, как антибиотики подавляют рост патогенных микроорганизмов. Эти знания могут помочь преодолеть устойчивость к существующим лекарствам.
«Большинство людей, когда они говорят о CRISPR, имеют в виду редактирование генов, — отмечают ученые. Обычно система CRISPR нацелена на ген, где она «разрезает ДНК пополам», объяснили они. Ген можно редактировать, пока клетка восстанавливает повреждение.
Но на этот раз сотрудники работали с очищенной формой CRISPR, известной как CRISPRi. CRISPRi был спроектирован так, чтобы не разрезать ДНК. Вместо этого он просто нацелен на ДНК, блокируя доступ других белков к конкретному гену.
Исследователи показали, что если они уменьшают количество белка, на которое нацелен антибиотик, бактерии становятся намного более чувствительными к более низким уровням препарата. Таким образом, тысячи генов одновременно могут быть подвергнуты скринингу в качестве потенциальных мишеней для антибиотиков, помогая ученым узнать, как работают антибиотики и как их улучшить.