По мере развития технологий редактирования генов при помощи CRISPR ученым все чаще необходимы способы ингибирования или блокировки этого процесса — молекулы анти-CRISPR.
Медики из Института Брода и Бригамской женской больницы в новом исследовании заявили, что нашли молекулы, которые могут безопасно и быстро блокировать процесс редактирования ген с помощью CRISPR.
По словам старшего автора нового исследования Амиты Чоуди, в аналогичных работах другие ученые занимаются поиском ингибиторов CRISPR среди крупных белков, тогда как эта группа медиков сконцентрирована на изучении возможностей применения синтетических низкомолекулярных объектов.
В рамках исследования ученые собрали платформу для скрининга, которая может точно измерять активность фермента CRISPR внутри клетки. Нейросеть провела анализ более 15 тыс. потенциальных биологических соединений и их реакции на CRISPR, чтобы выявить наиболее эффективные для ингибирования.
Врезка
Одно соединение — BRD0539 — оказалось способно ингибировать фермент Cas9 и отвязывать его от ДНК. Его активность очень зависела от дозы, что позволит в будущем управлять степенью ингибирования практически в прямом эфире. Кроме того, BRD0539 оказалась стабильна в плазме и легко удаляема из крови.
Ученые отмечают, что пока молекулы не могут использоваться в клинических испытаниях, поскольку генетики только начали исследовать применение BRD0539 в процессе ингибирования.