Весной «Хаябуса-2» совершил первую посадку на астероид Рюгу — аппарат спустил на космическое тело модули MASCOT, которые собрали с его поверхности первые образцы грунта. Затем зонд произвел выстрел по астероиду с высоты 500 м пенетратором SCI (Small Carry-on Impactor), состоящим из медного снаряда массой 2,5 кг и 4,5-килограммового заряда взрывчатого вещества. Снаряд врезался в Рюгу со скоростью 2 км/час.
Взрыв оставил небольшой кратер на Рюгу, в который позже сядет зонд и соберет частицы астероида. После взрыва «Хаябусе-2» пришлось совершать маневры около астероида, чтобы избежать столкновения с осколками.
Зонд начал спуск к поверхности астероида в ночь на 11 июля, приземлился и завис на высоте 8,5 м над точкой C01-Cb, расположенной неподалеку от взрывного кратера. Спуск проходил на скорости от 40 до 10 см в секунду — в конце аппарат выстрелил по точке танталовой пулей, собрав разлетевшиеся пыль и обломки породы при помощи грунтозаборного устройства.
Предполагается, что подповерхностный материал с Рюгу образовался в первые десятилетия существования Вселенной. Собранный зондом материал будет отправлен на Землю в контейнере, который должен прибыть в 2020 году.