Ученые разработали инструмент для секвенирования кольцевой ДНК. Открытие генетиков из Университета Альберты описано в журнале Nature Protocols.
Кольцевая ДНК распространена в организмах некоторых вирусов, бактерий и архей. Она представляет собой не двойную спираль линейной ДНК, а замкнута в кольцо. Недавно ученые обнаружили кольцевую ДНК внутри ядер клеток человека и растений, названную внехромосомной кольцевой ДНК (eccDNA).
По мнению ученых, кольцевая ДНК также может встречаться в раковых клетках и даже отвечать за их способность быстро размножаться. Исследователи уже начинали изучение роли, которую играет eccDNA в раковых клетках, но прогресс был затруднен из-за отсутствия эффективных методов для изучения и упорядочения.
В новом исследовании ученые создали инструмент секвенирования кольцевой ДНК на основе алгоритма, названного CIDER-Seq.
Мы разработали новый метод молекулярной биологии и новый алгоритм биоинформатики для окончательного получения полноразмерных последовательностей eccDNA. Наш метод позволяет полностью упорядочить эти молекулы и дает исследователям инструмент, позволяющий лучше понять, что они на самом деле делают в клетке.
Деванг Мехта, ведущий автор исследования
По словам авторов работы, метод будет очень полезен в сельском хозяйстве, поскольку многие вирусы, поражающие сельскохозяйственные культуры, имеют кольцевую ДНК.
Ранее ученые создали 3D-модель, которая поможет разрушить ДНК раковых клеток.
Читайте также:
— Ученые выяснили, куда пропала Луна в 1110 году. Её закрыло облако пепла
— Анализ древних минералов показал высокий уровень кислорода на Земле 2 млрд лет назад
