Ученые разработали программу, которая быстро моделирует сложные биомолекулярные системы. Это что-то вроде вычислительного микроскопа, который позволяет ученым понять взаимодействие в структуре белка на молекулярном уровне. Это нужно для того, чтобы понять, как COVID-19 проникает в организм человека.
Наши модели — это первые полностью гликозилированные полноразмерные модели белка SARS-CoV-2 шипа (S), доступные другим ученым. Наша команда потратила дни и ночи, чтобы построить модели на уровне криоэлектронной микроскопической (крио-ЭМ) структуры.
Вонпилоу Им, профессор факультета биологических наук и биоинженерии Университета Лихай
Структуру белка S определяют с помощью крио-ЭМ структуры, но эта модель имеет много «слепых пятен». Поэтому ученые сначала смоделировали недостающие аминокислотные остатки, а затем и другие области. Кроме того, группа ученых смоделировала все потенциальные гликаны (или углеводы), связанные с S-белком. Эти гликаны предотвращают распознавание антител, что затрудняет разработку вакцины. Они также создали вирусную мембранную систему белка S для моделирования молекулярной динамики.
Ученые планируют использовать эти модели для проведения новых исследований по профилактике и лечению COVID-19.
Читать также:
У коронавируса нашли щит из сахара. Он помогает быстрее заражать клетки
В Антарктиде нашли первое яйцо динозавра: посмотрите, как он мог выглядеть