Новости 15 декабря 2020

Нейросеть обучили искать левозакрученную ДНК

Далее

Российские биоинформатики создали нейросеть, которая может определить в какую сторону закручена спираль ДНК: вправо или влево.

Ранее ученые считали, что все молекулы ДНК представляют собой спирали, закрученные вправо, однако после того, как геном проанализировали, выяснилось, что это не всегда так. 

Некоторые участки хромосом закручены влево их еще называют Z-ДНК, а те, что закручены вправо B-ДНК. Понимать, в какую сторону закручены хромосомы важно, так как это может быть причиной заболеваний, таких как рак, диабет и болезнь Альцгеймера.

Однако в диагностике формы спирали существуют трудности: у ученых пока нет точных представлений о том, как часто подобные сегменты встречаются внутри хромосом, что управляет их формированием и как может меняться их структура с течением времени. Это связано как с большими размерами генома, так и со сложностями в поиске участков Z-ДНК.

Для того, чтобы упростить эту задачу, российские биоинформатики. Для того, чтобы ее обучить, они использовали информацию о уже известных участках генов, а также данные о том, как регулируется активность генов и синтез белков в клетках.

Самую эффективную модель на основе этого типа нейросетей ученые использовали, чтобы предсказать, где могут находиться еще неизвестные участки Z-ДНК в геноме человека. Биоинформатики надеются, что в ближайшее время они смогут проверить предсказания и использовать подобные данные для изучения той роли, которую Z-ДНК играет в работе организма.

Читать также:

Названо растение, которому не страшно изменение климата. Им питается миллиард человек

Носимый датчик сигнализирует о том, что у человека COVID-19

Земля в процессе шестого вымирания. Как это отразится на человечестве