Новый ИИ определяет трехмерную форму биомолекул. Обычно на это тратят миллионы долларов
Наука 27 августа 2021

Новый ИИ определяет трехмерную форму биомолекул. Обычно на это тратят миллионы долларов

Далее

Аспиранты Стэнфордского университета под руководством адъюнкт-профессора разработали ИИ, который вычисляет точную трехмерную форму молекул.

Определение трехмерной формы биологических молекул — это самая сложная проблема в современной биологии. Компании и исследовательские институты тратят миллионы долларов на то, чтобы понять, как выглядит и взаимодействует конкретная молекулярная структура, но не всегда это приводит к результату.

Авторы новой работы использовали методы машинного обучения и разработали подход, который решает эту проблему, так как предсказывает их точную структуру. Исследователи отмечают, что их подход можно применять даже для таких молекул и структур, которые наиболее трудно определить экспериментально.

Алгоритм аспирантов предсказывает точные молекулярные структуры и на основе этого можно понять, как они работают в разных областях: это поможет как в фундаментальных биологических исследованиях, так и при разработке лекарств.

Белки  — это такие машины в молекулярном масштабе, которые выполняют всевозможные функции. Для того, чтобы сделать какое-то действие, они могут связываться с другими белками. Если вы знаете, что пара белков вовлечена в заболевание, а также понимайте, как они оба взаимодействую, то можно попытаться сделать лекарство, которое будет бить в одну точку. 

Стефан Эйсманн, аспирант Стенфордского университета

ИИ научился находить фундаментальные концепции белков, которые являются ключевыми для формирования молекулярной структуры. И, что важно по мнению авторов, в него не загружали заранее данные по конкретным белкам, это могло бы сделать алгоритм предвзятым к ним и сбить с толку при глобальном анализе. 

Поэтому алгоритм находит данные и характеристики белков, о которых ученые не знали ранее. 

Во время эксперимента алгоритм успешно справился с белками и аспиранты протестировали его на молекулах-РНК. В результате ИИ в каждом случае справлялся с головоломкой, хотя не был разработан специально для для структур РНК.

Читать далее:

Космический корабль в несколько километров: все, что известно о новом проекте Китая

COVID-19 мутирует, а вакцины модернизируют: как бороться с новыми штаммами

Появился суперконденсатор размером с пылинку: он в 3 тыс. раз меньше аналогов