Новый метод секвенирования ДНК сохраняет расположение клеток в тканях

Авторы новой работы создали свою технику секвенирования ДНК с пространственным разрешением, ее назвали slide-DNA-seq.

Новый подход к секвенированию ДНК — Slide-DNA-seq — анализирует срезы неповрежденной ткани, в которых каждая клетка остается на своем первоначальном месте. Это отличает подход от обычных методов секвенирования, где клетки диссоциируются перед извлечением ДНК. 

Во время использования метода авторы применили мельчайшие шарики, каждый из которых был помечен уникальным пространственным штрих-кодом и прикреплен к специально подготовленным предметным стеклам, для захвата ДНК из ткани.

Каждый шарик размером с клетку. Вместе они похожи на пиксели на камере, которая делает снимки геномных изменений в каждой клетке ткани. 

Фэй Чен, сотрудник Института Брода

После фиксации геномных изменений исследователи использовали метод Slide-seq на основе РНК, его разработали еще в 2019 году. В нем используются профили экспрессии генов, чтобы определить и распознать типы и подтипы клеток в срезе ткани.

Мы можем использовать одни и те же  шарики для захвата транскриптома из каждой клетки, а также объединить эти два измерения в мультимодальное изображение. 

Фэй Чен, сотрудник Института Брода

Иначе говоря, исследователи могут видеть изменения как в ДНК клеток, так и в экспрессии генов.

Исследователи применили эту технику к модели метастатического рака у мышей, а также к образцу первичной опухоли у пациента с колоректальным раком. В каждой ткани исследователи смогли идентифицировать субпопуляции раковых клеток в различных регионах, соответствующих уникальным эволюционным путям генома и состояниям экспрессии генов.

Читать далее

Зонд Mars Express «пообщался» с китайским ровером на Красной планете

Исследование из Китая: штамм омикрон обходит защиту от вакцинации и перенесенного COVID-19

Посмотрите на рыбу с прозрачным лбом: ее мозг и глаза видно сквозь голову

Подписывайтесь
на наши каналы в Telegram

«Хайтек»новостионлайн

«Хайтек»Dailyновости 3 раза в день

Первая полоса
Ютубер собрал из «мусора» ручной лазер, прожигающий алмазы
Новости
Физики придумали, как создать настольный ускоритель частиц с мощностью гигантских установок
Наука
Китайский робот научился готовить пельмени и пользоваться палочками
Новости
Цифровые лидеры нового времени: объявлены лауреаты ежегодной Премии Digital Leaders-2025
Новости
Древнейший «арт-объект» неандертальцев с отпечатком автора, нашли в Испании
Наука
На Урале разработали сверхпрочное покрытие для защиты авиадвигателей
Наука
Сверхтонкая линза делает видимым инфракрасное излучение
Наука
Новый закон об иностранных мессенджерах вступил в силу в России
Новости
Больше миллиона Гбит в секунду: японцы побили рекорд скорости передачи данных по оптоволокну
Новости
Хаос во благо: физики создали новый инструмент для квантового мира
Наука
Hugging Face выпустила недорогих человекоподобных роботов с открытым кодом
Новости
Китайский аккумулятор для электромобиля выдержал наезд 36-тонного танка
Новости
Воспитанники детских домов изучат основы работы с нейросетями
Новости
Четвероногий робот из Цюриха научился играть в бадминтон с людьми
Новости
В MIT раскрыли механизм набора веса из-за жирной пищи и как обратить его вспять
Наука
60 000 лет рядом: ученые выяснили, кто стал первым паразитом человека
Наука
Ректора Университета Иннополис избрали членом-корреспондентом РАН
Иннополис
В Корее робопса научили паркуру и бегу по стенам: посмотрите, что он может
Новости
Древний череп «человека-муравья» нашли в Аргентине
Наука
На селфи марсохода попал неожиданный объект: его заметили не сразу
Космос