Ученые разработали новый вычислительный метод, чтобы отслеживать, как конкретные мутации влияют на передачу SARS-CoV-2. Это поможет лучше понять биологию вируса и контролировать вспышки.
Чтобы понять, как мутации коронавируса нового типа влияют на его передачу, ученые использовали математические модели статистической физики в эпидемиологии для создания нового метода наблюдения и анализа. Он позволяет просматривать данные геномного наблюдения с течением времени и во многих регионах мира, а также находить влияние различных мутаций на передачу SARS-CoV-2. Исследование показало, что метод лучше всего объясняет эволюцию вируса на протяжении всей пандемии COVID-19.
«Несколько новых особенностей нашего метода заключаются в том, что он может учитывать перемещение инфицированных людей между регионами. Другие модели на это неспособны. Наш метод основан на физике и позволяет записать точное математическое выражение для эффектов передачи различных мутаций, а не полагаться на численное моделирование для оценки этих параметров», — объясняет Джон Бартон, доцент кафедры физики и астрономии Калифорнийского университета в Риверсайде. Метод также достаточно чувствителен, чтобы выявить механизмы передачи SARS-CoV-2, которые ранее считались нейтральными.
После проверки метода ученые применили его к более чем 1,6 млн последовательностей SARS-CoV-2 из базы данных GISAID, которые были собраны в 87 географических регионах. Результаты исследования представят на мартовском собрании Американского физического общества.
Читать далее
Вероятно, протоны гораздо меньше, чем считалось ранее
Эксперты заявили, что на спутниковые снимки попал истребитель шестого поколения
Омикрон и дети: как болеют новым штаммом самые маленькие и на что обратить внимание