Новый инструмент анализа данных, разработанный исследователями из Йельского университета, выявил конкретные типы иммунных клеток, связанные с повышенным риском смерти от COVID-19. Ученые сообщают о своих результатах в журнале Nature Biotechnology.
Используя технологию машинного обучения исследователи обнаружили, что некоторые вспомогательные Т-клетки (TH17) связаны с более высокой смертностью от COVID-19. Это происходит, когда они объединяются с клетками иммунной системы IL-17 и IFNG. Ученые отмечают, что, измеряя их количество в крови, можно предсказать, выживет пациент или умрет от коронавируса с точностью до 83%.
Клетки иммунной системы (Т-клетки и В-клетки) продуцируют антитела, которые обеспечивают защиту от патогенов. Например, от коронавируса, который вызывает COVID-19. Крупномасштабный анализ данных миллионов клеток дал ученым общее представление о реакции иммунной системы на SARS-CoV-2. Также обнаружили, что некоторые реакции иммунитета иногда вызывают воспаление и смерть у пациентов.
Чтобы выяснить, какие клетки виноваты в этом, ученые использовали Multiscale PHATE — инструмент машинного обучения, разработанный в Йельском университете. Он позволяет исследователям обрабатывать данные любого разрешения. Технология основана на алгоритме под названием PHATE, созданном в лаборатории Смиты Кришнасвами, доцента генетики и компьютерных наук.
«Мы смогли ранжировать факторы риска смертности, чтобы показать, какие из них наиболее опасны», — добавила биолог. По ее словам, теоретически новый инструмент анализа данных можно использовать для точной оценки риска множества заболеваний, не только COVID-19.
Читать далее
Самое большое генеалогическое древо человечества показало историю нашего вида
Физики воссоздали способности Т-1000 из «Терминатора-2» в лаборатории
Ученые, возможно, нашли недостающее звено между одноклеточными и клетками человека