Исследователи с помощью ИИ от Google проанализировали узлы белков и сгенерировали более 100 тыс. новых комбинаций. В ходе экспериментов они также сгенерировали самый сложный белковый узел за все время исследований в этой сфере.
Исследователи объяснили, что химический состав белка определяет его трехмерную структуру, и это уже больше полувека одна из самых больших проблем в биофизике. Знания о «складывании» белков очень востребованы, потому что они вносят значительный вклад в понимание различных заболеваний и их лечение. Поэтому исследовательская группа DeepMind компании Google разработала AlphaFold — искусственный интеллект, предсказывающий 3D-структуры.
Теперь команда, состоящая из исследователей из Университета Иоганна Гутенберга в Майнце (JGU) и Калифорнийского университета в Лос-Анджелесе, более детально изучила эти структуры и рассмотрела их в связи с узлами. Белки с узлами могут не только использоваться для оценки качества предсказаний структуры, но и поднимать важные вопросы о механизмах сворачивания и эволюции белков.
Они исследовали около 100 тыс. сгенерированных новых белковых узлов. Их целью было выявление редких высококачественных структур, содержащих сложные и ранее неизвестные белковые узлы, чтобы обеспечить основу для экспериментальной проверки предсказаний AlphaFold. В ходе исследования они нашли самый сложный узловой белок за всю историю исследований.
«Новые открытия также позволяют понять эволюционные механизмы, лежащие в основе таких редких белков», — отметил Роберт Ранкель, физик-теоретик, также участвовавший в проекте. Результаты исследования появились в журнале Protein Science.
«Мы уже наладили сотрудничество с Калифорнийским университетом, чтобы подтвердить эти структуры экспериментально. Это направление исследований сформирует представление сообщества биофизиков об искусственном интеллекте», — добавили ученые.
Читать далее:
Телескоп «Джеймс Уэбб» сделал первый снимок Юпитера: на нем сразу 9 двигающихся целей
Ученые поняли, почему у Т-Рекс и других крупных динозавров были маленькие «руки»
В старейшей миссии «Вояджер 1» произошел странный сбой, который не получается устранить