Кейсы 15 сентября 2016

Amaryllis Nucleics проводит секвенирование РНК за 4 часа

Далее

Стартап Amaryllis Nucleics создал улучшенный метод биологической транскрипции генов, ускоряющий получение генетических данных из РНК, а также более дешевый и точный. Разработка была представлена на хакатоне TechCrunch Disrupt SF в категории «биотех», несколько необычной для аудитории, более привыкшей к цифровым технологиям.

«Когда мы учились в университете, — рассказывает Майк Ковингтон, сооснователь компании, — мы часто выполняли секвенирование РНК, и это слишком дорого обходилось и отнимало слишком много времени. Так что мы решили разработать новый протокол машинного чтения РНК — не только более дешевый и быстрый, но и более точный, чем другие».

Как нередко бывает, открытие было сделано «более или менее случайно». Рационализируя существующий протокол секвенирования РНК, ученые обратили внимание на странные данные. «Майк смог использовать свои знания по информатике, чтобы разобраться в этом механизме. Так мы смогли начать оптимизацию метода, пока не добились оптимальной работы», — рассказал второй основатель стартапа, Брэд Таунсли.

Оптимизация оказалась впечатляющей — время обработки сократилось на 50-90% по сравнению с другими техниками, и аналогичным образом уменьшилась стоимость.

Создав компанию и получив патент на изобретение, Таунсли и Ковингтон начали выпускать стартовые наборы, которые рассылали в лаборатории, университеты и частные организации. Им оставалось только следовать инструкциям и проводить транскрипцию быстрее и точнее.

Amaryllis готов выполнять всю работу и сам, но данных получается так много, что проще бывает переслать почтой диск, чем сохранять их на сервере. В остальном стартап пребывает на начальной стадии развития и надеется полностью передать производственный процесс на аутсорс, пишет TechCrunch.

Совершен прорыв к новой электронике

Секвенируют ДНК не только на Земле. В конце августа космонавтка NASA Кейт Рубинс провела первое испытание технологии на борту МКС с помощью аппарата Minion. Теперь диагностировать заболевания и идентифицировать опасные микробы можно не прерывая полет.