Разработан метод борьбы с супербактериями

Прием антибиотиков не всегда помогает справиться с заболеванием. Часто их действию мешают бактерии, живущие в пищеварительном тракте человека: они обмениваются генами с болезнетворными бактериями и те вырабатывают сопротивляемость антибиотикам, превращаясь в супербактерии, от которых не существует эффективного лекарства. Поэтому знание резистома — набора генов сопротивляемости в микрофлоре кишечника — может значительно улучшить результаты лечения. Однако традиционный метод получение данных о резистентности занимает недели. За это время резистом может существенно измениться.

Новый метод, названный poreFUME, использует секвенирование генома бактерий с помощью нанопор. По сравнению с аналогами он действует очень быстро, потому что не требует выращивания фекальных бактерий, долгого и непростого процесса. Кроме того, изобретенное датскими учеными устройство транслирует данные в реальном времени, так что пользователь не должен ждать окончания анализа, чтобы начать изучать информацию.

«С помощью нашего метода можно за 1-2 дня получить полный отчет о резистоме и, как следствие, начать лечение заболевания быстрее и с лучшими результатами, чем прежде», — говорит Эрик ван дер Хельм, один из авторов статьи, опубликованной в журнале Nucleic Acid Research.

Результаты эксперимента показали 97% точность метода poreFUME по сравнению с обычными технологиями определения резистома. Кроме того, благодаря использованию компактного устройства секвенирования MiniON, стоимость процедуры оказалась сравнительно низкой. Один такой аппарат стоит от $1000, тогда как аналогичные устройства секвенирования обходятся от $50 000 до $10 млн, пишет EurekAlert.

Устойчивая к новейшим видам антибиотиков энтеробактерия инфицирует в год почти 9300 жителей США и убивает около 900. Ее и раньше было сложно проследить, а теперь она сумела выработать сопротивляемость даже к карбапенемам — новейшему классу антибиотиков. Американские ученые проявляют обеспокоенность в связи с распространением этой инфекции.