Биологи испытают оптические процессоры для анализа ДНК

В отличие от обычных микрочипов, процессор Optalysys использует лазерный луч для выполнения математических вычислений, известных как преобразования Фурье. Закодировав данные в лучах света, которые могут взаимодействовать друг с другом, он выполняет вычисления за один шаг, тогда как традиционному компьютеру понадобилось бы несколько этапов. Затем результат отправляется для обработки обычными микрочипами. По мнению Ника Нью, главы Optalysys, эта технология особенно хорошо подходит для идентификации зон сходства в данных.

Первый продукт компании выполняет преобразования Фурье в 10 раз быстрее, чем графическая карта Nvidia P6000, которую обычно используют в высокопроизводительных компьютерах, и при этом тратит только 25% энергии.

Скоро станет понятно, какое практическое применение могут иметь эти цифры — на этой неделе специалисты-генетики — в частности, Институт Эрлама и Университет Манчестера, а также Университет штата Орегон (США) — начнут бета-тестирование этого «железа» на примере поисков сходств в ДНК. Для этого Optalysys создала программу, моделирующую инструмент, который биологи используют для поиска коротких фрагментов ДНК внутри громадного генома — процесс, который Нью сравнил с поиском иголки в стоге сена.

Биологи будут использовать эту систему через облако в течение трех месяцев. К лету стартап планирует выпустить коммерческую версию железа и софта. Их стоимость глава компании пока не разглашает, но говорит, что аппаратное обеспечение, которое требуется для их создания, неуклонно дешевеет, поскольку применяется в потребительской электронике, например, проекторах. Следует подчеркнуть, что такое железо едва ли заменит процессоры обычных ноутбуков, но способно помочь решать профильные задачи в определенных узких областях, сообщает MIT Technology Review.

Летом специалисты МТИ объявили о создании оптического процессора для глубокого обучения, который тратит в 1000 раз меньше энергии и способен лучше справляться с задачами, которые слишком сложны для традиционных компьютерных чипов (CPU и GPU).