Роскосмос запустил «Прогресс МС-09» 10 июля 2018 года к МКС. В рамках запуска ведомство впервые реализовало сверхкороткую двухвитковую схему доставки кораблей к МКС — обычно космический грузовик добирается более двух суток, однако «Прогресс МС-09» долетел до МКС за 3,5 часа.
«Прогресс МС-09» доставил на МКС топливо, расходные материалы, научное оборудование, провиант, посылки для экипажа, а также скафандр «Орлан-МКС» и научно-образовательные спутники «СириусСат-1» и «СириусСат-2», собранные школьниками совместно со специалистами компании «Спутникс» на базе стандартизированной платформы.
Использованные космические корабли топятся в так называемом Кладбище космических кораблей — закрытом для судоходства участке в южной части Тихого океана глубиной более 4 км. Оно расположено южнее острова Рождества, в 3,9 тыс. км к востоку от новозеландского города Веллингтон. Ежегодно в нем топятся десятки космических объектов, самым известным была станция «Мир» в 2001 году.