В ходе эксперимента группа биологов под руководством Вилле Фримана посадила на трех делянках по 16 кустов помидоров. Почва в этих делянках уже была 15 лет заражена патогеном Ralstonia solanacearum, вызывающим увядание томата.
В течение семи недель ученые следили за развитием томатов. К концу эксперимента заболеваемость достигла 54% от всей популяции. После этого ученые сравнили 12 здоровых растений с 12 увядшими.
Оказалось, что больше всего на судьбу растений повлияла не плотность микробиомы или физико-химические свойства почвы, а преобладание определенных микробов вокруг корней. У здоровых томатов с самого начала опытов преобладали микробы из таксонов Alphaproteobacteria, Firmicutes и Cyanobacteria. У тех кустов, которые заболели, были распространены вредные таксоны — Acidobacteria, Actinobacteria и Verrucomicrobia.
После этого ученые взяли почву из горшков со здоровыми растениями и завядшими, снова поселили туда патоген, а затем и семена томатов. В почве, где ранее жили здоровые растения, заболели 20% рассады. При этом в почве от больных растений — 91%.
Ученые утверждают, что в дальнейшем эти эксперименты позволят разобрать степень влияния микробиоты почвы на жизнь растений и в некоторых случаях научиться спасать их от гибели.