Секвенирование генома тысяч образцов SARS-CoV-2 показывает, что рост заболеваемости происходит из-за появления новых вариантов коронавируса.
Несмотря на то, что у SARS-CoV-2 всего 15 генов, он постоянно мутирует. Большинство из этих изменений не имеют большого значения, однако некоторые влияют на скорость его передачи.
Авторы новой работы изначально анализировали геномы 150 штаммов SARS-CoV-2. Они классифицировали вспышки по стадиям: индекс (отсутствие вспышки), взлет, экспоненциальный рост и спад. Легкость передачи вируса определяется значением R, или репродуктивным числом, где R-среднее число новых инфекций, вызванных каждым инфицированным человеком.
Они объединили всю эту информацию в метрику под названием GENI для идентификации генома патогена. Сравнение показателей GENI с фазой эпидемии показало, что увеличение генетической изменчивости происходило как раз перед ростом заболеваемости.
Когда в конце марта британское правительство ввело локдаун, число новых случаев заболевания стабилизировалось, но мутации продолжали расти. Это показывает, что такие меры, как запрет собраний и социальное дистанцирование, эффективны в борьбе с распространением болезни в условиях быстрой эволюции вируса.
Читать далее
Самое штормовое место на Земле: почему пролив Дрейка — опаснейший путь в Антарктику
Новое урановое соединение побило рекорд аномальной проводимости
Ошибка эволюции: какие органы в организме человека работают нелогично