Большинство работ по восстановлению ДНК древних патогенов связано с крупными эпидемиями: чумой, вирусом оспы и источниками туберкулеза. В новой работе исследователи восстановили генетический код условно-патогенной кишечной палочки из древнего организма. Геном 400-летнего предка современной бактерии поможет исследователям понять, как она развивалась и адаптировалась.
Кишечная палочка обитает в кишечнике здоровых людей и животных. Хотя большинство форм безвредны, некоторые штаммы вызывают серьезные, иногда смертельные вспышки пищевых отравлений и инфекции кровотока. Выносливая и адаптируемая бактерия признана особенно устойчивой к лечению, отмечают авторы работы. E. coli действует как условно-патогенный микроорганизм, поражающий своего хозяина в периоды стресса, основного заболевания или иммунодефицита.
Для своего исследования ученые использовали мумифицированные останки Джованни д’Авалоса. Этот неаполитанский дворянин эпохи Возрождения умер в 1586 году в возрасте 48 лет. Его останки в числе прочих были обнаружены в 1983 году в аббатстве Святого Доменико Маджоре в Неаполе. Исследователи предполагали, что причиной смерти стало хроническое воспаление желчного пузыря из-за камней в нем.
Когда мы исследовали эти останки, не было никаких доказательств того, что у этого человека была кишечная палочка. В отличие от такой инфекции, как оспа, физиологических проявлений нет. Никто не знал, что это было.
Джордж Лонг, исследователь из Университета Макмастера, соавтор работы
Ученые отмечают, что кишечная палочка широко распространена в почве. Поэтому во время работы нужно было тщательно изолировать древние фрагменты целевой бактерии, которые были разрушены под воздействием окружающей среды.
Несмотря на все сложности, исследователям удалось на основе извлеченного материала реконструировать геном. Он состоял из одной хромосомы с 4446 генами и двух предполагаемых плазмид с 52 генами.
Изображение обложки: Division of Paleopathology of the University of Pisa
Читать далее:
Юная звезда «спрятала» то, что изменило представление ученых о Вселенной. Главное
Недалеко от Земли нашли две планеты, которые очень похожи на нашу
Раскрыто происхождение Черной смерти. Исследование ДНК привело в Среднюю Азию