Основанный учеными из МТИ стартап Kytopen изменил подход к внедрению ДНК в клетку. Обычно этот процесс отнимает много времени. Но американская компания собирается ускорить его в несколько раз и открыть скрытые возможности биотехнологий. С помощью ускоренной методики генетики смогут разрабатывать новые лекарства, топливо или продукты питания.
Процедура внедрения новой ДНК в организм, который ранее не подвергался модификации, может занять несколько месяцев и даже лет. При этом сам процесс введения ДНК довольно утомителен, так как проводится вручную и требует большой концентрации. С помощью традиционных методов генетики могут одновременно работать с 50 образцами клеток в час. Технология Kytopen дает возможность работать с 96 и более образцами, причем каждый из них может содержать миллионы клеток и генерировать миллиарды различных результатов. За час новая система способна обработать столько же, сколько старая за один год.
Обычно для внедрения ДНК в клетки ученые применяют метод электропорации — клетки подвергают воздействию тока, в результате чего поры в клеточной мембране раскрываются и впускают ДНК. Однако на процесс подбора оптимальных условий электрического поля у генетиков могут уйти месяцы и даже годы. Новый метод автоматически помогает определить наиболее подходящие условия для электропорации.
В интервью Fast Company ученые объяснили, как работает новый метод. В пипетку встраиваются миниатюрные канальцы, по которым клетки бактерий текут непрерывным потоком. Под воздействием тока поры в клеточной мембране раскрываются так, чтобы в них могла попасть ДНК. Структура канальца минимизирует воздействие электрического заряда, поэтому клетки не погибают в процессе.
В США начался бум строительства космодромов
Технологии
«Наука далеко шагнула в области создания ДНК, чтения ДНК, а также в анализе ДНК-данных и секвенировании генома. Однако внедрение ДНК в клетки до сих пор оставалось проблемой», — рассказал сооснователь Kytopen Пауло Гарсиа.
Новая технология позволит проводить эксперименты с новыми видами бактерий и дрожжей. По оценкам стартапа, из миллионов существующих видов бактерий ученые экспериментируют только с 1%, а генетической модификации подвергают еще меньшее количество организмов. Эксперименты с ранее неиспользованными организмами могут привести к созданию новых лекарств, антибиотиков и энзимов и раскрыть новые возможности в биологии.
Kytopen получил посевные инвестиции от акселератора The Engine, который базируется в МТИ. Обычно организация инвестирует в проекты, к которым сложно привлечь внимание традиционных венчурных компаний. Финансирование также получили разработчик систем быстрой доставки данных из космоса Analytical Space и создатель ИИ-систем iSee.
Молекулярная «машина времени» показала ключевую роль случая в эволюции
Кейсы
Интерес к разработке Kytogen уже проявил стартап Ginkgo Bioworks. Компания занимается массовым производством искусственных форм жизни. Экспериментируя с ДНК, ученые создают микроорганизмы для парфюмерии, пивоварения и других областей.